تم تطوير تطبيق هيئة منطقة المدينة المنورة الإلكتروني للتعريف بالهيئة وأهدافها ورؤيتها، وكذلك عرض آخر الأخبار الخاصة بالهيئة وأخبار المدينة المنورة وأخبار المملكة العربية السعودية وكذلك إعلانات الهيئة.
ويضم التطبيق صفحة خاصة بالخدمات الإلكترونية التي تقدمها الهيئة للمواطنين وأصحاب الأعمال وكذلك موظفي الهيئة.
ويستقبل التطبيق التنبيهات العامة والموجهة للمواطنين وكذلك التنبيهات الخاصة بمنسوبي ومنسوبات الهيئة.